1.广东历史文化研究所
所长：宋德华
成员：颜广文、刘曼容、陈向阳、肖自力、周永卫、何小燕、杨锦銮、段雪玉、詹坚固
2.民国史研究所
所长：肖自力
成员：夏 蓉、杨锦銮、黄珍德、黄金凤
3.冷战国际史研究中心
主任：姚 昱
成员：左双文、肖自力、黄珍德、黄金凤、黎英亮、周小兰、吕雪峰、尚劝余、张泽宇
4.欧洲研究所
所长：陈文海
成员：林中泽、贺璋瑢、尹 虹、张庆海、韩益民、黎英亮、周小兰、代国庆
5.中国周边国家研究所
所长：赵自勇
成员：贺璋瑢、张来仪、尚劝余、何 慧、黎英亮、宋一兵
6.西方史学史研究所
所长：张庆海
成员：张来仪、陈文海、赵自勇、韩益民、章 衍、周小兰
7.宗教史研究所
所长：林中泽
成员：贺璋瑢、何方耀、张来仪、陈文海、张庆海、吴 羽、章 衍、许展飞、代国庆
8.美国史研究所
所长：何 慧
成员：左双文、贺璋瑢、姚 昱、黎英亮、周小兰、黄金凤、万晓宏、史风华
9.出土文献和上古史研究所
所长：张淑一
成员：牛新房、唐洪志
10.社会时间史研究所
所长：吴 羽
成员：段雪玉、章 衍、许展飞、牛新房、周小兰、黎英亮、汪小虎
11.历史教学研究所
所长：王继平
成员：黄牧航、梁丽红、唐洪志